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基于cpDNA条形码鉴定铁皮石斛种质资源

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【类型】发表文章

【题名】

基于cpDNA条形码鉴定铁皮石斛种质资源

【责 任 者】付涛 胡仲义 何月秋 周亚美 毛阳正

【作者单位】

宁波城市职业技术学院

【关 键 词】

铁皮石斛;cpDNA;条形码;种质鉴定

【摘要】

    为选择适合鉴定铁皮石斛的条形码,以5份铁皮石斛种质资源和1份串珠石斛(外类群)为试验材料,采用cpDNA条形码技术进行分子鉴定。结果表明,5个条形码序列( matK、rbcL、trnH-psbA、petA-psbJ和rpl32-trnL) 种间遗传距离均远高于种内遗传距离,符合作为条形码的基本要求,其中petA-psbJ变异位点最多( 8.03%),说明其进化速率亦最快,petA-psbJ 可作为石斛属候选条形码之一; 单个条形码鉴定率均较低(<60%) ,核心条形码 matK + rbcL 鉴定率亦较低(68.75%),而在核心条形码基础上结合其它序列( ≥3) 却可以显著提高鉴定率(≥81.25%),matK +rbcL+petA-psbJ鉴定率达到 100% ,可作为铁皮石斛分子鉴定的最适条形码组合。综上,利用cpDNA条形码技术,可将不同种质资源的铁皮石斛区分开,基本上可将不同采集地的铁皮石斛聚类;同时,建议matK+rbcL+petA-psbJ作为铁皮石斛种质资源鉴定的DNA条形码。本研究结果为铁皮石斛种质资源的快速鉴定提供了一定的参考。

【语种】中文(简体)

【年份】2017

【基金项目】

浙江省教育厅科研项目( Y201533793),宁波城市职业技术学院校内重点项目( ZZX15064),宁波市自然科学基金(2015A610267)

【所属分类】教学参考/科研成果/发表文章

【录入时间】2017-09-10 13:10:51

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